PHES ODMプロジェクトの歴史と概要

新型コロナウイルスのパンデミックによる世界的な健康危機を受けて、下水ベースのサーベイランスはウイルスの蔓延を追跡するための重要なツールとなりました。下水サーベイランスが世界的に採用されたことは、臨床検査へのアクセスや住民の健康志向に影響されることなく、疾患の時空間的な進行を明らかにする能力などの長所を示しています。しかし、その急速な普及は、標準化された相互運用可能なデータの欠如という新たな課題をもたらしました。

このギャップを認識し、PHES ODMはこの世界的なニーズの交差点で考案されました。PHES ODMは、カナダの著名な学術研究所のパートナーシップである、オタワ大学デラトラ研究所、ラバル大学のヴァンロレゲム研究所、そしてオタワ病院研究所のダグ・マヌエル博士から生まれました。特に、カナダ公衆衛生庁とオンタリオ州下水サーベイランスイニシアチブは、その創設において重要な協力者でした。オープンで協調的な多分野にわたる取り組みとして、すぐに国際的な注目を集め、研究室や新興のサーベイランスプログラムを結集し、下水データの収集・使用方法の理解と標準化を取り組みました。

「堅牢で相互運用可能なデータの収集と使用を可能な限り簡単にする」というビジョンのもと、ODMが考案されました。ODMの初版では、世界中の50を超えるサーベイランスプログラムと試験ラボからの知見と協力を統合しました。主な目標は、特定されたすべてのサーベイランスプログラム、辞書、データセットを網羅する辞書を備えた包括的なデータモデルを確立することでした。データモデルにとどまらず、ODMの共同研究者は、データの収集、検証、保存、共有を容易にするデータパイプラインの「ツールキット」を構想しました。

‍

同業他社および大規模廃水データコミュニティへの謝辞

PHES-ODMはオープンで共同作業的なプロジェクトであり、当初から存在しています。パンデミックの際に起こった進歩とその達成スピードは、プロジェクト、専門分野、研究者の間のオープンなコラボレーションによってのみ可能になりました。このようなエコシステムから生まれたプロジェクトとして、このランドスケープの構築と定義を支援してくれた同僚、他の研究者、データモデルに感謝しています。特に、米国疾病対策センターの全国廃水センチネルシステム（USCDC NWSS）、欧州ヌクレオチド協会（ENA）、ゲノム疫学公衆衛生同盟（PHA4GE）、国立バイオテクノロジー情報センター（NCBI）、および国、地域、および学術研究所があります。他の人々はこの分野に多大な貢献をしてきました。私たちはPHES-ODMを構築し、より相互運用性の高いデータに向けて構築することができました。このコミュニティがなければ、このような作業は実現できなかったでしょう。