Historique et à propos du projet PHES ODM

En réponse à la crise sanitaire mondiale provoquée par la pandémie de Covid-19, la surveillance basée sur les eaux usées est apparue comme un outil essentiel pour suivre la propagation du virus. L'adoption mondiale de la surveillance basée sur les eaux usées reflète sa force, comme sa capacité à faire la lumière sur la progression spatio-temporelle des maladies sans être influencée par l'accessibilité des essais cliniques ou les tendances des populations à rechercher la santé. Pourtant, son adoption rapide a créé de nouveaux défis, principalement le manque de données normalisées et interopérables.

Reconnaissant cette lacune, le PHES ODM a été conçu à l'intersection de ce besoin mondial. Originaire du Canada, il est né d'un partenariat entre des laboratoires universitaires de premier plan : le Laboratoire de recherche Delatolla de l'Université d'Ottawa, le Laboratoire Vanrolleghem de l'Université Laval et le Dr Doug Manuel de l'Institut de recherche de l'Hôpital d'Ottawa. Notamment, l'Agence de la santé publique du Canada et l'Initiative de surveillance des eaux usées de l'Ontario ont été des collaborateurs clés lors de sa création. En tant qu'initiative ouverte, collaborative et multidisciplinaire, elle a rapidement gagné du terrain à l'échelle internationale, réunissant des laboratoires et des programmes de surveillance naissants pour comprendre et normaliser les méthodes de collecte et d'utilisation des données sur les eaux usées.

L'ODM a été conçu dans le but de "rendre la collecte et l'utilisation de données robustes et interopérables aussi faciles que possible". L'édition inaugurale de l'ODM a intégré les idées et les collaborations de plus de 50 programmes de surveillance et laboratoires d'essai du monde entier. L'objectif premier était d'établir un modèle de données complet, avec un dictionnaire englobant tous les programmes de surveillance, dictionnaires et ensembles de données identifiés. Au-delà d'un modèle de données, les collaborateurs de l'ODM ont envisagé une "boîte à outils" pour faciliter la collecte, la validation, le stockage et le partage des données.

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Remerciements à nos pairs et à la grande communauté des données sur les eaux usées

Le PHES-ODM est un projet ouvert et collaboratif, et ce depuis le début. Les progrès réalisés pendant la pandémie et la rapidité avec laquelle ils ont été accomplis n'ont été possibles que grâce aux collaborations ouvertes entre les projets, les disciplines et les chercheurs. En tant que projet issu de cet écosystème, nous sommes reconnaissants à nos pairs, aux autres chercheurs et aux modèles de données qui ont contribué à construire et à définir ce paysage. Il s'agit notamment du National Wastewater Sentinel System (USCDC NWSS) des Centres américains de contrôle des maladies, de l'European Nucleotide Association (ENA), de la Public Health Alliance for Genomic Epidemiology (PHA4GE), du National Center for Biotechnology Information (NCBI), ainsi que des laboratoires nationaux, régionaux et universitaires. D'autres personnes ont apporté une contribution considérable à ce domaine. Grâce à leur travail, soit avec nous, soit qu'ils ont partagé librement, nous avons été en mesure de construire le PHES-ODM et d'évoluer vers des données plus interopérables. Aucun de ces travaux n'aurait été possible sans cette communauté.